Trở về hiện tại, cuộc chiến giữa Autobots và Decepticons vẫn dai dẳng. và nhóm của anh phát hiện ra sự thật về con tàu The Ark nhờ các bằng chứng từ các tàu thăm dò của NASA. Optimus và Ratchet bay lên mặt trăng, tìm thấy thi thể của người thầy mình – Sentinel Prime – cùng 5 cột trụ. Optimus dùng "Mặt nã lãnh đạo (Matrix of Leadership)" để hồi sinh cho Sentinel. Janet Jackson Number Ones Itunes Plus Aac M4a Upd — Her 1986
Cuối cùng, các cột trụ bị phá hủy bởi Bumblebee và Sam (sử dụng thiết bị do Que tặng). Cybertron sụp đổ và biến mất trong không gian, kế hoạch của Decepticon tan thành mây khói. Thành phố Chicago hoang tàn đổ nát. Autobots nhìn lên bầu trời và nhận ra thế giới của họ – Cybertron – đã thực sự mất đi. Họ không còn nơi nào để về. Teen Wolf Season 1 Complete Pack Top
Sam, Carly, cựu đặc vụ Simmons và nhóm lính biệt kích NEST quyết định đột nhập vào Chicago để cứu Carly và ngăn chặn thảm họa. Giữa lúc tuyệt vọng, các Autobots xuất hiện trở lại – họ đã giả chết để thám thính tình hình. Optimus nói với Sam: "Em không chọn судьchỗng, nhưng ta chọn giữ lời hứa của mình."
Tuy nhiên, Optimus Prime không khoan nhượng. Nhận thấy Megatron vẫn còn mưu đồ xấu xa và Sentinel là kẻ phản bội không thể tha thứ, Optimus đã tung đòn quyết định: Giết chết Megatron và tiễn Sentinel về cõi vĩnh hằng với thanh rìu của chính ông ta.
Đúng lúc Sentinel định tung đòn kết liễu Optimus, Megatron lao vào tấn công Sentinel Prime từ phía sau, bắn trọng thương đối thủ. Megatron tuyên bố mình muốn giành lại quyền lực. Sentinel ngã quỵ.
Sentinel Prime kích hoạt các cột trụ, mở ra cánh cổng không gian trên bầu trời Chicago. Hàng trăm chiến binh Decepticon ẩn nấp trên mặt trăng đã đổ bộ xuống Trái Đất. Chúng chiếm đóng Chicago, biến thành phố thành pháo đài kiên cố và tuyên bố Trái Đất thuộc về chúng. Chính phủ Mỹ sợ hãi quyết định trục xuất Autobots. Chiếc tàu Kinetic Theory mang Optimus và các Autobots rời đi đã bị Starscream bắn hạ, dường như toàn bộ Autobots đã chết. Decepticon tưởng chừng đã thắng lợi và bắt đầu bắt con người làm nô lệ để tái thiết Cybertron.
Trong khi đó, – người hùng của hai phần phim trước – đang chật vật tìm việc làm. Anh tốt nghiệp đại học nhưng không xin được việc, sống bám vào bạn gái mới – cô nàng trợ lý xinh đẹp và thông minh tên là Carly . Sam cảm thấy lạc lõng khi Optimus và các Autobots được chính phủ Mỹ coi như "vũ khí bài trừ" trong khi anh bị bỏ quên. Tuy nhiên, nhờ sự giúp đỡ của cựu đặc vụ Simmons , Sam phát hiện ra âm mưu của người Decepticon: chúng đã giấu các cột trụ còn lại trên mặt trăng từ lâu và chờ đợi Sentinel Prime hồi sinh để kích hoạt chúng. Phần 2: Sự phản bội và kế hoạch chiếm đóng Sam phát hiện ra bạn trai cũ của Carly – ông chủ giàu có Dylan Gould – thực chất là một con người cộng sự với Decepticon. Dylan đã lừa Sam để Sam thú nhận kế hoạch của Autobots.